Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cse1lQ9ERK4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cse1lQ9ERK4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms