Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms