Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clstn1Q9EPL2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms