Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms