Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Swt1Q9DBQ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms