Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms