Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2aQ9DAR1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms