Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Asf1bQ9DAP7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms