Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9DA42 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9DA42 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9DA42 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9DA42 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9DA42 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9DA42 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms