Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmbim4Q9DA39 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmbim4Q9DA39 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms