Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg7Q9D906 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg7Q9D906 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms