Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms