Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1qtnf2Q9D8U4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1qtnf2Q9D8U4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms