Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c6Q9D8P7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms