Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin37Q9D8N6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms