Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2af1Q9D883 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms