Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slx4ipQ9D7Y9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slx4ipQ9D7Y9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms