Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms