Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms