Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4f1Q9D5Q6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer4f1Q9D5Q6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms