Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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