Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms