Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lonrf3Q9D4H7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lonrf3Q9D4H7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms