Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcc1Q9D4H2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms