Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam90a1bQ9D4F3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms