Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D454 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D454 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D454 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D454 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D454 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D454 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D454 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms