Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus10Q9D3U0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms