Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stag1Q9D3E6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms