Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt20Q9D312 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms