Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms