Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms