Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms