Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D1F3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D1F3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms