Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T7

Gkn3, Gastrokine-3, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn3Q9D0T7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn3Q9D0T7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms