Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Thumpd2Q9CZB3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms