Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Srfbp1Q9CZ91 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srfbp1Q9CZ91 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms