Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nsfl1cQ9CZ44 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsfl1cQ9CZ44 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms