Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYS6

Uncharacterized protein C2orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYS6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CYS6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYS6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYS6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms