Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms