Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca4Q9CWM2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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