Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.65
Sycp2Q9CUU3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Sycp2Q9CUU3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sycp2Q9CUU3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms