Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930519P11RikQ9CUJ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms