Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud1Q9CUB6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms