Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pard3bQ9CSB4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pard3bQ9CSB4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms