Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl28Q9CR40 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms