Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CQM1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQM1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CQM1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms