Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccer1Q9CQL2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccer1Q9CQL2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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