Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Znhit3Q9CQK1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znhit3Q9CQK1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms