Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DenrQ9CQJ6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms