Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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